Medzinárodné
CHINMULTIHIT – Identifikácia malých molekúl z tradičných čínskych bylín na multicieľovú terapiu neurodegenerat ívnych ochorení a objasnenie mechanizmu účinku | |
Discovery and Mechanism of Small Molecules from Traditional Chinese Herbs for Multitarget directed Therapy of Neurodegenerative Diseases | |
Program: | Bilaterálne – iné |
Zodpovedný riešiteľ: | doc. RNDr. Gažová Zuzana, DrSc. |
Anotácia: | Neurodegeneratívne ochorenia spojené s nesprávnym zbaľovaním proteínov (NDD), ako sú Alzheimerova aParkinsonova choroba, vedú k rozsiahlym zmenám a postupnému odumieraniu neurálnych buniek v centrálnomnervovom systéme. Napriek odlišným symptómom, NDD zdieľajú niekoľko spoločných patogénnych mechanizmov.V súčasnosti neexistuje liek pre tieto ochorenia a komplexnosť ich patológie si vyžaduje inovatívne terapeutickériešenia. V tomto projekte bude použitá nová stratégia multi-cieľových ligandov (MTDL), ktorá sa zameriava navývoj nových zlúčenín modulujúcich viacero procesov spojených s NDD súčasne. Zameriame sa na čínske byliny –Angelica sinensis, Ligusticum chuanxiong, a Cinnamomum cassia. Cieľom projektu je preskúmať anti -agregačnýpotenciál týchto rastlinných extraktov a ich derivátov na Aβ peptid aj α -synukleín, pričom by mali vykazovať ajneuroprotektívne a protizápalové vlastnosti. Projekt kombinuje odborné znalosti a skúsenosti oboch výskumnýchtímov v oblasti. Nesprávneho zbaľovanie proteínov a patológie NDD, a umožní nám získať komplexné údajepomocou komplementárnych prístupov, čo bude viesť k návrhu možných terapeutických alternatív proti týmtoochoreniam. Táto výskumná spolupráca bude navyše vynikajúcou príležitosťou pre mladých členov oboch tímovnaučiť sa nové techniky v dobre vybavených laboratóriách vo Východočínskej univerzite a ÚEF SAV, a získať taknové skúsenosti s prácou v medzinárodnom vedeckom prostredí. |
Doba trvania: | 1.7.2024 – 30.6.2026 |
LEAPAB – Inhibícia agregácie A-beta peptidov proteínmi vyskytujúcimi sa počas neskorej embryogenézy: nový prístup liečby Alzheimerovej choroby | |
Inhibition of A-beta Peptides Aggregation by Late Embryogenesis Abundant Proteins: A New Approach for Alzheimer’s Disease Treatment | |
Program: | Bilaterálne – iné |
Zodpovedný riešiteľ: | RNDr. Bednáriková Zuzana, PhD. |
Anotácia: | Alzheimerova choroba (ACH) je najbežnejšou neurodegeneratívnou poruchou, ktorá má nejasnú patofyziológiu. V súčasnosti trpí na ACH viac ako 55 miliónov ľudí, čo je spojené s vysokými finančnými nákladmi pre spoločnosť. Navyše, predpokladá sa, že do roku 2050 sa počet pacientov s ACH zvýši viac ako dvojnásobne. Patológia ACH je úzko spojená s tvorbou depozitov obsahujúcich amyloid β (Aβ) peptid usporiadaný do nerozpustných amyloidných fibríl. Napriek mnohým súčasným štúdiám, ktoré sú zamerané na identifikáciu inhibítorov agregácie Aβ peptidov, liek na ACH stále chýba. Cieľom predkladaného projektu je implementovať molekulárne mechanizmy, ktoré sa uplatňujú pri pozoruhodnom fenoméne niektorých rastlín, a to ich tolerancii voči vysychaniu s cieľom vyvinúť novú stratégiu voči Aβ agregácii. Pri vysúšaní rastlín dochádza k vysokej produkcii špecifických proteínov – proteíny neskorej embryogenézy (LEAPs), ktoré pomáhajú stabilizovať prirodzenú štruktúru proteínov a membrán pomocou mechanizmov, ktoré momentálne nevieme úplne vysvetliť. Primárnym cieľom projektu je preskúmať štruktúrne vlastnosti LEAPs izolovaných z Ramonda serbica, ich interakcie s Aβ peptidmi a ich vplyv na agregáciu Aβ peptidov. Po prvé, pripravíme rekombinantné LEAPs, ktoré budú veľmi efektívne inhibovať agregáciu Aβ peptidov. V ďalšom kroku budeme analyzovať sekundárnu štruktúru LEAPs za rôznych podmienok so zameraním na ich prechody z usporiadaného do neusporiadaného stavu. Následne budeme študovať Aβ antiagregačný potenciál LEAPs in vitro a identifikujeme interakcie Aβ/LEAP, čo umožní vyvinúť nové stratégie liečby ACH. Vedecké tímy zapojené do tohto projektu (slovenský z ÚEF SAV a srbský z IMGGE) majú dostatočné skúsenosti v oblasti produkcie proteínov, analýzy štruktúry proteínov a amyloidnej agregácie. Prenos odborných znalostí medzi partnerskými laboratóriami bude zabezpečený vzájomnou edukáciou doktorandov a postdoktorandov zapojených do tohto projektu. |
Doba trvania: | 1.4.2024 – 31.12.2025 |
Azobenzénové deriváty ako potenciálne terapeutiká pre Alzheimerovu chorobu | |
Azobenzenes as potential Alzheimer\’s theranostic agents | |
Program: | Mobility |
Zodpovedný riešiteľ: | RNDr. Bednáriková Zuzana, PhD. |
Doba trvania: | 1.1.2023 – 31.12.2024 |
ANOMATY – Interakcie amyloidných fibríl a nanočastíc pre biomedicínske, biochemické a inžinierske aplikácie | |
Interactions of nanoparticles with amyloid fibrils: from therapy to nanomaterials | |
Program: | Bilaterálne – iné |
Zodpovedný riešiteľ: | doc. RNDr. Gažová Zuzana, DrSc. |
Anotácia: | Napriek tomu, že tvorba amyloidných fibríl je spojená s patogenézou mnohých ľudských ochorení, amyloidné fibrilymajú potenciál byť využité aj na prípravu nových materiálov. Existuje veľké množstvo experimentálnych štúdiítýkajúcich sa interakcií nanočastíc (NPs) s amyloidmi s rôznym výsledkom, pričom niektoré NPs sa iba viažu naamyloidné fibrily, iné ich disociujú. Projekt, ktorý zahŕňa niekoľko najmodernejších komplementárnych výpočtovýcha experimentálnych metodík, má za cieľ využiť dvojakú povahu NPs v komplexe s amyloidnými fibrilami preaplikácie v nanomedicíne (terapia amyloidóz) a chemickom inžinierstve (hybridné nanomateriály pre vylepšeniekatalytickej aktivity NPs). Na štúdium použijeme Au-, Ag- a Pd- nanočastice s rôznymi fyzikálno-chemickýmivlastnosťami a amyloidné fibrily vytvorené z lyzozýmu, inz ulínu a α-laktalbumínu. Ďalším cieľom je systematickéštúdium sklonu globulárnych proteínov k tvorbe amyloidných fibríl s kontrolovanými vlastnosťami. Údaje oštrukturálnych a fyzikálno-chemických vlastnostiach fibríl môžu navyše vyplniť prázdne miesta vo veľkej skladačkebiológie akou je patogenéza amyloidóz. |
Doba trvania: | 1.1.2022 – 31.12.2023 |
Stabilita a agregácia globulárnych proteínov v prítomnosti biokompatibilných iónových kvapalín | |
Stability and aggregation of globular proteins in the presence of biocompatible ionic liquids | |
Program: | Mobility |
Zodpovedný riešiteľ: | RNDr. Fedunová Diana, PhD. |
Doba trvania: | 1.1.2021 – 31.12.2022 |
CHINMEDAMY – Identifikácia a mechanizmus účinku malých molekúl využívaných v tradičnej čínskej medicíne na liečbu Alzheimerovej choroby | |
Discovery and Mechanism of Small Molecule Compounds from Traditional Chinese Medicine for treatment of Alzheimer \’s Disease | |
Program: | Bilaterálne – iné |
Zodpovedný riešiteľ: | doc. RNDr. Gažová Zuzana, DrSc. |
Doba trvania: | 1.1.2018 – 31.12.2019 |
NGP-NET – Neglobulárne proteíny – od sekvencie ku štruktúre, funkcii a aplikácii v molekulárnej fyziopatológii | |
Non-globular proteins – from sequence to structure, function and application in molecular physiopathology | |
Program: | COST |
Zodpovedný riešiteľ: | doc. RNDr. Gažová Zuzana, DrSc. |
Anotácia: | Neglobulárne proteíny (NGPs) zahŕňajú rôzne molekulové javy, ktoré odporujú tradičnej paradigme sekvencia – štruktúra – funkcia proteínu. NPGs obsahujú prirodzene neusporiadané úseky, tandemové úseky, domény agregácie, sekvencie s nízkou komplexnosťou a transmembránové domény. Aj keď stále viac dôkazov naznačuje, že NGPs hrajú ústrednú úlohu v mnohých ľudských ochorení, o ich funkcii vieme veľmi málo. Lepšiemu pochopeniu úlohy NGPs v ľudskej fyziopatológii bránil málo systematický výskum v tejto oblasti. Projekt si kladie za úlohu vytvoriť pan-európsku sieť vedeckých skupín, ktoré sa venujú NGPs s cieľom lepšej koordinácie a posilnenia výskumu v tejto oblasti. V rámci projektu bude na základe dohody zainteresovaných odborníkov vytvorená nová klasifikácia NGPs Prezentovaná bude pomocou novovytvorených webových stránok, spoločných stretnutí, vedeckých dielní zameraných na tematiku NGPs. |
Web stránka projektu: | http://www.cost.eu/COST_Actions/bmbs/BM1405 |
Doba trvania: | 27.7.2015 – 25.3.2019 |
Národné
Low-molecular-weight compounds targeting amyloid-related diseases | |
Low-molecular-weight compounds targeting amyloid-related diseases | |
Program: | PostdokGrant |
Zodpovedný riešiteľ: | RNDr. Gančár Miroslav, PhD. |
Doba trvania: | 1.1.2024 – 31.12.2025 |
Kapitálový booster pre schémy na podporu výskumu a vývoja (Viaczložkové ligandy ako modulátory cieľov spojených s patogenézou Alzheimerovej choroby) | |
– | |
Program: | Plán obnovy EÚ |
Zodpovedný riešiteľ: | doc. RNDr. Gažová Zuzana, DrSc. |
Doba trvania: | 1.7.2024 – 30.6.2025 |
Objasnenie počiatočných štádií amyloidnej agregácie proteínov – od mechanizmu k terapii | |
Unraveling the early events of protein amyloid aggregation – from mechanism to therapy | |
Program: | VEGA |
Zodpovedný riešiteľ: | doc. RNDr. Gažová Zuzana, DrSc. |
Anotácia: | Štruktúrne zmeny poly/peptidov podmieňujúce tvorbu amyloidných agregátov sú spojené s doteraznevyliečiteľnými ochoreniami, ako napr. Alzheimerova choroba alebo diabetes typu II. Všeobecné mechanizmytvorby amyloidných fibríl a ich charakterizácia sú pomerne dobre známe, avšak počiatočné štádiá fibrilizáciepoly/peptidov ostávajú stále neobjasnené. Projekt je zameraný na pochopenie mechanizmov, ktoré vedú ktvorbe pre-fibrilárnych (čiastočne ro/zbalených intermediátov, nukleačných jadier, oligomérov) a fibrilárnychamyloidných agregátov vybraných globulárnych a prirodzene rozbalených proteínov. Zameriame sa na štúdiumkinetiky tvorby pre-fibrilárnych štruktúr, ich morfológie a cytotoxicity za rôznych experimentálnych podmienok a vprítomnosti vybraných interakčných partnerov (malé molekuly, nanočastice). Získané výsledky prispejú klepšiemu pochopeniu počiatočných mechanizmov tvorby amyloidnej agregácie a identifikácii inhibítorov sterapeutickým potenciálom pre amyloidné ochorenia. |
Doba trvania: | 1.1.2021 – 31.12.2024 |
NANOVIR – Nanočastice pre riešenie diagnosticko-terapeutických problémov s COVID-19 (NANOVIR) | |
– | |
Program: | Štrukturálne fondy EÚ Výskum a inovácie |
Zodpovedný riešiteľ: | Ing. Závišová Vlasta, PhD. |
Anotácia: | Projekt NANOVIR prispeje k zvýšeniu účasti slovenských výskumných inštitúcií v medzinárodných výskumných projektoch zameraných na boj proti pandémii vyvolanej ochorením COVID-19 formou podpory bilaterálnej medzinárodnej vedeckej spolupráce s Aix-Marseille University, Francúzsko. Predmetom výskumu projektu je riešenie diagnosticko-terapeutických problémov ochorenia COVID-19 s využitím magnetických nanočastíc. Projekt sa zaoberá prípravou, vývojom a ladením vlastností magnetických nanočastíc pre efektívnejšiu izoláciu vírusovej RNA z balastu komplexnej klinickej vzorky. Magnetické nanočastice budú povrchovo a štruktúrne modifikované tak, aby sa dosiahla ich lepšia účinnosť pri separácii. Kvalita pripravených nanočastíc bude overená izoláciou vírusovej RNA pre detekciu rôznych RNA vírusov metódou RT-qPCR. Súčasne bude vyvinutý aj postup na kontrolu kvality odoberaných sterov s využitím izolácie bunkovej DNA a jej detekcie vo vzorke s PCR dôkazom celulárneho génu. Druhou výskumnou aktivitou projektu NANOVIR je pohľad na pandémiu COVID-19 z terapeutického hľadiska, keď core-shell magnetické nanočastice obalené pórovitou SiO2 budú použité ako nosič antivirotík Remdesivir, Favipiravir alebo Pacritinib a bude sledovaný vplyv takýchto systémov s predlženým účinkom na viabilitu a metabolickú aktivitu buniek v in vitro prostredí ako aj v živom organizme v in vivo prostredí. Projekt je riešený v spolupráci partnerských výskumných inštitúcií žiadateľa, UPJŠ a partnerov, UVLF a ÚEF SAV na území Košického samosprávneho kraja (KSK) a prispeje k tvorbe konzorcií pre riešenie multidisciplinárnych problémov medzi prioritnými oblasťami a k rozvoju existujúcich univerzitných vedeckých parkov a výskumných centier pri UPJŠ, UVLF a ÚEF SAV vo väzbe na priority RIS3 SK. Projekt predpokladá rozšírenie výskumnej a inovačnej infraštruktúry a kapacít na rozvoj excelentnej vedy a príspevok k hospodárskemu rastu v RIS3 špecializácii Zdravie obyvateľstva a zdravotnícke technológie. |
Web stránka projektu: | https://websrv.saske.sk/uef/veda-a-vyskum/projekty-v-ramci-opvai/nanovir/ |
Doba trvania: | 3.3.2021 – 30.6.2023 |
BIOVID-19 – Vývoj biomodelov pre zlepšenie hodnotenia účinnosti liekov a látok, ktoré majú potenciál pri liečbe COVID-19 (BIOVID-19) | |
– | |
Program: | Štrukturálne fondy EÚ Výskum a inovácie |
Zodpovedný riešiteľ: | Ing. Koneracká Martina, CSc. |
Anotácia: | Napriek tomu, že štúdie s vakcínami proti COVID-19 sú v súčasnosti dobre rozpracované, stále existuje naliehavá potreba nájsť ďalšie terapeutické možnosti a tonajmä s cieľom postihnúť komplikácie vyplývajúce z vírusovej infekcie, najmä dysregulovanú imunitnú odpoveď a systémové komplikácie spojené s progresiouCOVID-19. Testovanie terapeutických možností je však značne obmedzené, pretože doposiaľ žiadny zvierací model plne nereprodukuje kľúčové znaky závažnejformy ochorenia COVID-19. Cieľom projektu je preto vyvinúť animálny model pre zlepšenie hodnotenia účinnosti liekov identifikovaných ako látky, ktoré majú potenciál pri liečbe COVID-19. Využijeme na to súčasné poznatky o tomto ochorení, ale hlavne nálezy získané zo vzoriek pacientov, ktorí umreli v priamej súvislostis infekciou COVID-19. Na vyvinutom modeli otestujeme aktuálne najvhodnejšiu liečbu. CEM SAV má bohaté skúsenosti s vývojom a charakterizáciou nových modelov. |
Web stránka projektu: | https://websrv.saske.sk/uef/veda-a-vyskum/projekty-v-ramci-opvai/biovid-19/ |
Doba trvania: | 29.6.2021 – 30.6.2023 |
MULTIHIT – Multifunkčné inhibítory poly/peptidov spojených s Alzheimerovou chorobou | |
Multi-target inhibitors of poly/peptides associated with Alzheimer´s disease | |
Program: | APVV |
Zodpovedný riešiteľ: | doc. RNDr. Gažová Zuzana, DrSc. |
Doba trvania: | 1.7.2019 – 1.6.2023 |
Samousporiadanie poly/peptidov do amyloidných agregátov – mechanizmus, inhibícia a cytotoxicita | |
Self-assembly of poly/peptides into amyloid aggregates – mechanism, inhibition and cytotoxicity | |
Program: | VEGA |
Zodpovedný riešiteľ: | doc. RNDr. Gažová Zuzana, DrSc. |
Anotácia: | Amyloidné supramolekulárne komplexy vytvárané poly/peptidmi patria medzi najrozšírenejšie prirodzene sa vyskytujúce systémy podliehajúce procesu samozbaľovania. Tento proces ovplyvňujúci ich funkciu sa spája s viac ako 30 závažnými amyloidnými ochoreniami medzi ktoré patrí aj Alzheimerova choroba a diabetes mellitus.Doteraz nie je známy presný mechanizmus amyloidného samousporiadania poly/peptidov a neexistuje účinná liečba amyloidných ochorení. Cieľom projektu je štúdium mechanizmu amyloidnej agregácie polypeptidov s rozdielnou natívnou štruktúrou a identifikácia inhibítorov samozbaľovania poly/peptidov, keďže inhibícia tvorby amyloidných štruktúr predstavuje jeden z možných terapeutických prístupov pri amyloidózach. Zameriame sa aj na určenie korelácie medzi morfológiou amyloidných agregátov a ich cytotoxicitou ako aj medzi štruktúrnymi vlastnosťami efektívnych inhibítorov a ich anti-amyloidnou aktivitou. |
Doba trvania: | 1.1.2017 – 31.12.2020 |